Algunas veces el yum queda corrupto, y hay que hacer una serie de pasos para volverlo a la normalidad.
rm -f /var/lib/rpm/__db*
rpm --rebuilddb
yum clean all (to be sure everything really cleans up)
yum makecache
Para un testeo.
yum --skip-broken
Fuente:
http://forums.fedoraforum.org/showthread.php?t=285585
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